На месте нынешнего Кайсери было поселение Мазака. В 18 г. н.э. в честь императора Тиберия его переименовали в Кесарею и сделали столицей римской провинции Каппадокия.
Говорят, что именно здесь римляне схватили Апостола Петра.
Город переместили на 2 км к северу от античного акрополя во времена Византийской империи. Вокруг появился монастырь, основанный епископом Святым Василием Великим – основателем христианского монастизма.
Город находился в стратегически выгодном положении, быстро разбогател и превратился в крупный культурный центр.
В 1067 г. город захватили сельджуки во главе с Kılıс Arslan II. Они сделали Кесарею столицей эмирата Danismend, включавшего Каппадокию, Сивас и Амасью.